As fluoroquinolonas, como a ciprofloxacina, a levofloxacina, a ofloxacina, a norfloxacina e o ácido nalidíxico, inibem a topoisomerase II na bactéria. Os usos clínicos incluem: antraz, cervicite, prostatite bacteriana, infecções do trato urinário complicadas, infecções respiratórias por P. aeruginosa nos pacientes com fibrose cística, otite externa invasiva causada pela P. aeruginosa, osteomielite crônica por bacilos gram-negativos e erradicação da Salmonella typhi nos portadores. E os efeitos adversos são distúrbios gastrintestinais, erupções cutâneas e artropatia.
Os antibióticos glicopeptídeos, como a vancomicina e a teicoplanina, inibem a síntese da parede celular bacteriana. A vancomicina é usada contra colite pseudomembranosa, infecções estafilocócicas multirresitentes e algumas formas de endocardite, mas geram febre, erupções cutâneas, flebite no local da injeção, ototoxicidade, nefrotoxicidade e reações de hipersensibilidade.
Os antibióticos polimixínicos, (polimixina B e colistina), alteram os fosfolipídios da membrana celular das bactérias. São usados apenas para tratamento tópico de infecções nas orelhas, olhos e pele, pois são neurotóxicos e nefrotóxicos.
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